防火牆設定分為以下五種情形，若用戶須申請防火牆請針對該設定進行申請。

a. 「外部網際網路區」至「用戶區」（外對內）的防火牆規則設定：用戶可直接透過用戶自助服務管理系統（https://iaas.nat.gov.tw） 線上申請。

b. 「用戶區」至「外部網際網路區」（內對外）的防火牆規則設定：用戶可直接透過用戶自助服務管理系統（https://iaas.nat.gov.tw） 線上申請，惟須經過本中心審核。

c. 「跨用戶區」（內對內）／網域名稱防火牆規則設定：申請方式詳見『附件2、行政院及所屬委員會雲端資料中心_系統防火牆規則暨資安系統設定申請說明書』，並填具『附件2、行政院及所屬委員會雲端資料中心_系統防火牆規則暨資安系統設定申請表』申請開通。 

d. 「同一用戶區」（內對內）的防火牆規則設定：不需申請防火牆規則。

e. 「用戶區」至「系統服務區」的防火牆規則設定：系統已預先開通，故不需申請防火牆規則。