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依CPS規範，憑證IC卡在發出後，由用戶自行妥善保管，在憑證過期失去效力後也相同。用戶須自行保管到期的憑證IC卡。 CA也不會廢止用戶到期之憑證，而是失去效力，所以依時間的流逝，逐漸有更多IC卡片失去效用， 無法使用於應用系統。
到期的憑證依X.509的規範並不會放到憑證廢止清冊(CRL)中，如前所述憑證的自然到期並不會被視為廢止，再者如有在未到期之前已做憑證廢止者，則在該憑證到期後，將自CRL中被移除。對於應用系統來說，則CRL檔案有可能會變小。
請妥善保管憑證IC卡，工作轉調時需列入業務移交，無論已過期或仍有效力之憑證IC卡，均勿損毀或丟棄。
用戶如果有以舊IC卡片加密的檔案，應先做解密，以免卡片的晶片在更久的將來損毀，而無法做檔案的解密。至於解密的電子文件的安全保存方法，可重新申請一張新的憑證IC卡做檔案加密，或是以其他加密的方法做保存。