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部會因特殊目的所設立的學校，例如僑委會所設立的「中華函授學校」，這些部會直接設立的學校歸由GCA負責簽發憑證，簽發的憑證為政府機關(構)憑證，而不是由XCA簽發學校憑證。國防部所設立的軍事學校、內政部所設立的警察學校及其他部會特殊目的所設立的學校，雖然都具有學校之名，也兼受教育部指導，但是這些學校依據相關組織條例或教育條例，是直屬於這些部會的附屬機關(構)，因此歸由GCA負責簽發政府機關(構)憑證，而不是由XCA簽發學校憑證。